影片讲述独臂刀王刚赴日访友，路遇中国遗孤，并与座头市结识，两人之间因言语不通闹出许多笑话，最后更因误会难解，不得不性命相搏。瞎子座头市以闪电般的拔刀术著称，而独臂大侠王刚则以独门金刀刀法和轻功与之对抗

黑锹小角（小林昭二 饰）率领的忍者军团行动失败，柳生鞘香（松尾嘉代 饰）带领其麾下的女子刺客军团继续追踪拜一刀父子的踪迹。阿波藩的蓝玉制造密法被幕府盗走，拜一刀（若山富三郎 饰）受聘刺杀盗走密法之人。